Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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