Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LINC00312Q9Y6C7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms