Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR1DQ9Y2S0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms