Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX7Q9UNH6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX7Q9UNH6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms