Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DSEQ9UL01 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms