Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MBD1Q9UIS9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MBD1Q9UIS9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms