Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL13Q9P2N7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms