Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRBP1Q9P2E9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms