Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCMF1Q9P0J7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms