Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNIH4Q9P003 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNIH4Q9P003 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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