Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms