Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHAF3Q9NRP4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDHAF3Q9NRP4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms