Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPAG4Q9NPE6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms