Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIN28AQ9H9Z2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIN28AQ9H9Z2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms