Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSER1Q9C0I3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSER1Q9C0I3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSER1Q9C0I3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSER1Q9C0I3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSER1Q9C0I3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSER1Q9C0I3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSER1Q9C0I3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSER1Q9C0I3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSER1Q9C0I3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSER1Q9C0I3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSER1Q9C0I3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSER1Q9C0I3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCSER1Q9C0I3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCSER1Q9C0I3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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