Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL4Q9C0H6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms