Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZYG11BQ9C0D3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZYG11BQ9C0D3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZYG11BQ9C0D3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ZYG11BQ9C0D3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZYG11BQ9C0D3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZYG11BQ9C0D3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms