Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZCCHC2Q9C0B9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZCCHC2Q9C0B9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms