Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
YTHDF1Q9BYJ9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
YTHDF1Q9BYJ9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms