Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RSPO3Q9BXY4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RSPO3Q9BXY4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms