Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF17Q9BXT8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms