Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUP58Q9BVL2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP58Q9BVL2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms