Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTDSS2Q9BVG9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms