Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLR3CQ9BUI4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms