Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A3Q9BRY0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms