Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms