Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RBBP8Q99708 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms