Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.4 ms