Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TEFMQ96QE5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms