Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFXN2Q96NB2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms