Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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SAMD8Q96LT4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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SAMD8Q96LT4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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SAMD8Q96LT4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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SAMD8Q96LT4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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SAMD8Q96LT4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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SAMD8Q96LT4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SAMD8Q96LT4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SAMD8Q96LT4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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SAMD8Q96LT4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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SAMD8Q96LT4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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