Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP47Q96K76 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP47Q96K76 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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