Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC97Q96F63 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms