Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC9Q92623 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms