Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBXN4Q92575 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms