Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPDL3AQ92484 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms