Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
COPS9Q8WXC6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COPS9Q8WXC6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COPS9Q8WXC6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COPS9Q8WXC6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COPS9Q8WXC6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COPS9Q8WXC6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COPS9Q8WXC6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
COPS9Q8WXC6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COPS9Q8WXC6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COPS9Q8WXC6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COPS9Q8WXC6 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COPS9Q8WXC6 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COPS9Q8WXC6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COPS9Q8WXC6 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COPS9Q8WXC6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
COPS9Q8WXC6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COPS9Q8WXC6 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
COPS9Q8WXC6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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COPS9Q8WXC6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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COPS9Q8WXC6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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COPS9Q8WXC6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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COPS9Q8WXC6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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COPS9Q8WXC6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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COPS9Q8WXC6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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COPS9Q8WXC6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
COPS9Q8WXC6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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