Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPBAR1Q8TDU6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPBAR1Q8TDU6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms