Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIX1LQ8IVB5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms