Protein–RNA interactions for Protein: Q86US8

SMG6, Telomerase-binding protein EST1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6Q86US8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMG6Q86US8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms