Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms