Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC102BQ68D86 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC102BQ68D86 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC102BQ68D86 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC102BQ68D86 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC102BQ68D86 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC102BQ68D86 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms