Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
WSCD1Q658N2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms