Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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C10orf55Q5SWW7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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C10orf55Q5SWW7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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C10orf55Q5SWW7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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C10orf55Q5SWW7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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C10orf55Q5SWW7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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C10orf55Q5SWW7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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C10orf55Q5SWW7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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C10orf55Q5SWW7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C10orf55Q5SWW7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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