Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC27A3Q5K4L6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms