Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCTE1Q5JU00 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms