Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6CQ53S08 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms