Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTXN3Q4LDR2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTXN3Q4LDR2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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