Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NBPF8Q3BBV2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NBPF8Q3BBV2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms