Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HFEQ30201 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HFEQ30201 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HFEQ30201 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms